科學(xué)家開發(fā)出一種推斷人類譜系史的非參數(shù)統(tǒng)計方法

現(xiàn)代及古代人類基因組序列表征可揭示人類進(jìn)化歷程中未知的特征?；蚪M數(shù)據(jù)庫的不斷擴(kuò)大有助于實(shí)現(xiàn)對進(jìn)化更深入的理解。但是，樣本采集、分析手段的差異導(dǎo)致基因組數(shù)據(jù)庫中既包含真正的基因變異，又包含復(fù)雜的缺失與錯誤。因此，基因組數(shù)據(jù)庫具有高度異質(zhì)性。如何從該高度異質(zhì)的基因組數(shù)據(jù)中更全面了解人類進(jìn)化過程成為當(dāng)前重要挑戰(zhàn)之一。

近日，英國牛津大學(xué)研究團(tuán)隊在《Science》雜志上發(fā)表題為“A unified genealogy of modern and ancient genomes”的文章，建成目前最詳細(xì)的人類遺傳譜系之一，揭示世界各地個體如何相互關(guān)聯(lián)。

研究團(tuán)隊采用樹序列（tree sequences）描述人類祖先基因關(guān)系，通過對樹結(jié)構(gòu)的估計整合不同基因數(shù)據(jù)集并深入了解人類遺傳多樣性。研究團(tuán)隊利用非參數(shù)統(tǒng)計方法推斷現(xiàn)代及古代人類基因樣本的統(tǒng)一譜系，通過計算機(jī)仿真和經(jīng)驗數(shù)據(jù)分析共同驗證非參數(shù)統(tǒng)計方法有效性，并應(yīng)用非參數(shù)統(tǒng)計方法揭示人類遺傳多樣性和進(jìn)化特征。該研究通過整合不同數(shù)據(jù)庫的現(xiàn)代和古代人類基因組數(shù)據(jù)，建成了目前最詳細(xì)的人類遺傳圖譜。在樣本基因組信息基礎(chǔ)上添加位置數(shù)據(jù)信息后，該研究團(tuán)隊使用非參數(shù)估計器預(yù)測共同祖先居住地，成功重現(xiàn)了人類進(jìn)化史上的關(guān)鍵事件，如走出非洲。

該研究表明全基因組譜系為研究人類歷史和進(jìn)化提供了一個強(qiáng)大平臺。

論文鏈接：

https://www.science.org/doi/10.1126/science.abi8264

注：此研究成果摘自《Science》雜志，文章內(nèi)容不代表本網(wǎng)站觀點(diǎn)和立場，僅供參考。

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