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基因測序

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我國科學家揭示肺癌致病變異的遺傳新機制

近十年來,基于高通量芯片和基因型填補策略的大樣本全基因組關聯(lián)研究已高效鑒定了八十余個非小細胞肺癌發(fā)病相關遺傳變異,部分揭示了肺癌的發(fā)病機制,但仍存在一定的局限性。近期,南京醫(yī)科大學的科研團隊揭示了肺癌致病變異的遺傳新機制。

英科研團隊發(fā)現(xiàn)昆蟲遷徙背后的關鍵基因

英國??巳卮髮W科研人員領導的團隊確定了遷徙和非遷徙食蚜蠅之間的1500多種遺傳差異,有助于揭示昆蟲遷徙背后的原因。研究成果發(fā)表在《分子生態(tài)學》雜志上。

科學家開發(fā)腫瘤融合基因預測新工具

癌癥是由基因改變驅動的,這些改變包括小的變異,如單核苷酸替換、小的插入和缺失以及大的結構變異(SVs)。SVs可以引起基因融合的表達,從而推動腫瘤的發(fā)生和發(fā)展。

我國科學家繪制小鼠器官發(fā)生的時空轉錄組圖譜

空間轉錄組技術是研究復雜生物過程(如哺乳動物的胚胎發(fā)育)的工具。然而,目前的方法受分辨率、基因捕獲區(qū)域和觀察視野等限制,無法用于分析體積較大、三維的妊娠中期和晚期胚胎研究。利用DNA納米球陣列芯片和原位mRNA捕獲技術,深圳華大基因研究院等研究團隊繪制了小鼠器官發(fā)生的時空轉錄組圖譜。

迄今為止最完整的人類基因組測序結果正式發(fā)布

近日,《科學》雜志連發(fā)6篇論文,公布迄今為止最完整的人類基因組測序結果,這也是第一個完整無間隙的人類基因組序列。該系列研究主要由國際科學團隊端粒到端粒聯(lián)盟(T2T,Telomere-to-Telomere)完成,聯(lián)盟成員包括美國國家人類基因組研究所、加州大學圣克魯茲分校、華盛頓大學等。

科學家研究實現(xiàn)單細胞轉錄組的空間映射

單細胞RNA測序方法可以剖析單細胞的轉錄組表達,但不能保存空間信息。相反,空間轉錄組學可以檢測剖析組織切片中的空間區(qū)域,但不具備單細胞分辨率。美國德克薩斯大學研究團隊提出一種計算方法,揭示組織中單細胞轉錄組的空間結果。

科學家系統(tǒng)重建小鼠整個胚胎發(fā)育的細胞軌跡

美國華盛頓大學研究團隊提出了系統(tǒng)重建小鼠整個胚胎發(fā)育的細胞軌跡。該研究結果于近日發(fā)表在《Nature Genetics》上,題為:Systematic reconstruction of cellular trajectories across mouse embryogenesis。

科學家開發(fā)出對菌群中單個細菌進行高通量鑒定和定量的新技術

細菌以菌群的形式廣泛存在于地球上,了解菌群中細菌的組成和數(shù)量,對于研究菌群功能以及菌群如何影響宿主穩(wěn)態(tài)等問題至關重要。然而,目前的技術難以在單菌水平上測定菌群組成。

科學家構建基因表達調(diào)控DNA序列進化和適應度景觀研究框架

近日,美國科學家團隊在《Nature》上發(fā)表了題為“The evolution, evolvability and engineering of gene regulatory DNA”的文章,該研究基于釀酒酵母生物模式建立了啟動子(一種順式作用元件)深度神經(jīng)網(wǎng)絡模型。

研究報道人類基因組測序速度實現(xiàn)新突破

近期,斯坦福大學的科研人員完成了利用人工智能計算加速工作流程的DNA巨量測序技術,把人類基因組測序時間縮短至5小時2分鐘,創(chuàng)造了新的世界紀錄。

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