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人類微生物組計(jì)劃第二階段取得新進(jìn)展

    近日,美國(guó)哈佛大學(xué)和博德研究所的科研人員在Nature上發(fā)表了題為“Multi-omics of the gut microbial ecosystem in inflammatory bowel diseases”的文章,研究人員利用多組學(xué)技術(shù),針對(duì)在炎癥性腸?。↖nflammatory Bowel Diseases,IBD)期間微生物組的變化以及引發(fā)炎癥反應(yīng)的機(jī)制開展研究,為IBD的治療提供具有潛力的技術(shù)手段。

    IBD包括克羅恩病和潰瘍性結(jié)腸炎,在全世界數(shù)百萬(wàn)人中普遍存在。克羅恩病和潰瘍性結(jié)腸炎是一種復(fù)雜疾病,在臨床、免疫學(xué)、分子、遺傳和微生物水平上均具有異質(zhì)性。作為整合人類微生物組項(xiàng)目(HMP2或iHMP)的一部分,研究人員對(duì)132名受試者進(jìn)行了為期一年的研究,以生成疾病期間宿主和微生物活動(dòng)的綜合縱向分子譜(每人最多24個(gè)時(shí)間點(diǎn);總共2,965個(gè)糞便、活檢和血液樣本)。研究人員總結(jié)出炎癥性腸病活動(dòng)期間腸道微生物組功能性失調(diào)的綜合視圖,并發(fā)現(xiàn)兼性厭氧菌的特征性增加同時(shí)伴有專性厭氧菌的減少,微生物轉(zhuǎn)錄(例如梭菌屬)過(guò)程和代謝物庫(kù)(?;鈮A,膽汁酸和短鏈脂肪酸)的分子破壞,以及宿主血清中的抗體水平變化。疾病活動(dòng)時(shí)期也以時(shí)間變異性的增加為特征,具有特征性的分類學(xué)、功能和生化等方面的變化。

    該研究的結(jié)果和數(shù)據(jù),通過(guò)炎癥性腸病多組學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)(http://ibdmdb.org)開放,這是迄今為止對(duì)炎癥性腸病宿主和微生物活動(dòng)描述最全面的數(shù)據(jù)庫(kù),將為IBD的預(yù)后提供新型的生物標(biāo)志物,用于改善該疾病的治療。(摘譯自Nature, Published: 29 May 2019)

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